為充分發揮制度優勢，有效整合體制內優勢科技資源，快速形成國家生物育種產業創新中心的基本研發力量，按照省政府要求，經省委編辦批復同意，遴選河南省農業科學院生物育種部分優勢團隊的骨干力量，在河南省農科院作物設計中心的基礎上成立了河南省作物分子育種研究院（以下簡稱“研究院”）。研究院是河南省農業科學院直屬科研機構，主要職能任務是：開展農作物種質資源鑒定、評價創制；分子設計育種技術體系構建研究；農作物生物技術研究與應用；農作物新品種培育；農作物新品種、新技術示范推廣?，F設有綜合部、財務部、科研事業部、保障服務部4個管理部門和小麥分子育種創新團隊、小麥豐優育種創新團隊、花生育種創新團隊、大豆育種創新團隊4個研發團隊。研究院是國家生物育種產業創新中心科技創新板塊的運營載體，小麥國家工程實驗室、花生遺傳改良國家地方聯合工程實驗室、河南省麥類種質資源創新與改良重點實驗室等10余個國家和省級研究平臺依托研究院建立。

       研究院現有在編在崗職工49人，編外聘用35人，其中研究員12人，副研究員20人，博士30人?，F有中國工程院院士2人，中原學者3人，國家有突出貢獻中青年專家2人，國務院特貼專家6人，百千萬人才工程國家級人選4人，省優秀專家5人，省杰出專業技術人才2人，省學術技術帶頭人2人，省政府特殊津貼專家2人，國家產業技術體系首席科學家1人，崗位科學家1人，試驗站站長1人，省產業技術體系首席2 人。全院有3個省部級創新型科技團隊。

       按照國家發展改革委和省委省政府對生物育種中心的功能定位要求，根據“立足河南、服務全國、面向全球”的總站位，研究院圍繞科學高效、充滿活力、可持續發展的發展目標，強化體制機制創新，通過實施更大力度的開放創新、更具競爭力的人才政策、更具活力的運行管理機制，探索傳統育種組織方式向商業化育種轉變的實現路徑，形成了以農作物新品種選育為優勢和重點的研究領域，小麥、花生的品種改良研究處于全國領先水平，花生遠緣雜交育種跨入世界領先行列。